表达载体构建 标签是否正确表达
作者:admin 发布时间:2023-11-21 08:30:31 分类:笔记 浏览:130
克隆载体中加入一些与表达调控(具有转录/翻译所必需的DNA序列)有关的元件即成为表达载体。
如启动子(Promoter)、核糖体结合位点(RBS)、终止子等。
表达载体又分为过表达载体、干扰表达载体和正常表达载体三种。
基因过表达(gene overexpression)是将目的基因CDS克隆到相应的质粒或病毒载体上,利用载体骨架上构建的调控元件,使基因可以在人为控制的条件下实现大量转录和翻译,从而实现目的基因的过表达。
RNA干扰是在强组成型启动子下游插入反向重复片段的重组双元载体。
在RNAi载体中,目标基因的cDNA片段被克隆在间隔序列(spacer)的两端,这些片段通过头头相连或尾尾相连导致该转基因产生自我互补的hpRNA(分子内dsRNA)结构,可以特异将特定基因沉默,从而获得特定基因的功能丧失或者基因表达量降低。
正常表达载体和超表达载体组成:
(1)复制起始位点 Ori 即控制复制起始的位点。
原核生物 DNA 分子中只有一个复制起始点。
而真核生物 DNA 分子有多个复制起始位点;
(2)抗生素抗性基因可以便于加以检测,如 Amp+ ,Kan+等;
(3)多克隆位点 MCS 克隆携带外源基因片段;
(4)启动子促进 DNA 转录的 DNA 序列,这个 DNA 区域常在基因或操纵子编码序列的上游,是 DNA 分子上可以与 RNApol 特异性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。
增强子为真核基因组(包括真核病毒基因组)中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。
其作用与增强子所在的位置或方向无关。
即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。
沉默子-负增强子,负调控序列;
(5)核糖体结合位点(RBS,Ribosome-binding site)是mRNA分子5'(上游)的区段,能够结合核糖体正确定位至翻译启始位点,也能够控制mRNA翻译启始的准确度和效率。
(6)Terms 终止信号;
(7)加 poly(A)信号,可以起到稳定 mRNA 作用。
RNAi表达载体组成:
(1)正义基因片段:目的基因CDS片段200 bp左右特异性正向片段;
(2)反义基因片段:目的基因CDS片段200 bp左右特异性反向片段(与正义片段序列碱基互补配对,方向不同);
(3)内含子:用于在转录时通过拼接产生功能性间隔(spacer)内含子介导基因沉默。
(4)载体上其他元件类型同上。
注意:
其实,构建表达载体与构建克隆载体的实验方法并无区别,具体实验流程可参考载体构建入门攻略——克隆载体篇,需要注意的是目的基因插入到表达载体以后可以正确翻译。
这就需要在设计载体时进行自检。
l 酶切位点自检:如果进行计划使用酶切酶连方法进行载体构建,可以使用DNAMAN,Snapgene等软件对目的基因序列进行限制性酶切位点分析,检测选择的酶切位点在目标序列中存在。
如果使用同源重组方法进行载体构建,则无需考虑酶切位点的影响。
l 避免使用同尾酶:同尾酶是不同的酶,同尾酶之间的识别序列可以相同也可以不同,但产生相同的粘性末端,使用同尾酶造成的结果是片段插入载体的方向不固定,插入方向错误会导致无法正常表达翻译。
l 避免移码,将片段按照预期插入到表达载体序列中,从预期的ATG开始翻译,检查目的片段是否移码,翻译是否正常终止,再加上保护碱基。
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